種内ゲノム比較解析に向けた 日本で飼育しているハダカデバネズミのゲノム解読

（ポイント）がんや低酸素への強い耐性、そして長寿で知られるハダカデバネズミについて、日本で飼育されている個体のゲノムを高精度に解読しました。ゲノム解読の結果、本種では未発見であった遺伝子を167個発見し、既存の遺伝子に対して250個の修正モデルを提案しました。これにより遺伝子を種内または種間で比較する際に必要な精度と信頼性を高めました。74個の遺伝子に顕著な種内変異を確認し、その中には神経伝達物質の受容体など社会行動にかかわる可能性のある遺伝子が含まれていました。同定した変異遺伝子を表現型解析と組み合わせることで、個体差を遺伝子レベルで解明する手がかりとなります。ハダカデバネズミは健康長寿モデル哺乳類として注目されており、今回のデータは抗老化・疾患耐性機構の解明と将来的なヒトへの応用研究を推進する重要な基盤となります。

【概要】広島大学大学院統合生命科学研究科の栂浩平研究員と坊農秀雅教授、九州大学の岡香織助教、三浦恭子教授、東京科学大学の田中裕之助教、伊藤武彦教授、国立遺伝学研究所の豊田敦特任教授らは、日本で飼育されているハダカデバネズミのゲノム解読に成功しました。一般に、ゲノム情報は一種につき一つの配列が代表配列として決定されますが、ハダカデバネズミでは種内の遺伝的な違いが大きいことが指摘されており、従来のリファレンスゲノムでは多様性を捉えきれない可能性がありました。本研究では、日本で飼育されている個体のゲノムを新たに解読し、種内に存在するゲノム配列の違いを明らかにしました。その結果、リファレンスゲノムより多くの遺伝子を保有するゲノムが得られ、これまで報告されていなかった遺伝子や構造が不正確であった遺伝子を多数同定しました。今後、この遺伝子の多様性が生理的・行動的な特徴にどう関係するのかを検証することで、種内変異の生物学的意義の解明が期待されます。